Насчет пункта В – на моем опыте, ферменты довольно часто связываются/распознают один участок молекулы, а совершают действие на другой. Например, рестриктазы первого и третьего класса распознают один участок ДНК, а разрезают другой. Похожий случай может быть с AbI. Этой версии помогает то, что домен называется “связывающим”.
Киназа может распознать домен связывания, фосфорилировать субстратный пептид, он изменит из-за этого конформацию и сблизит YFP и CFP. Если добавить фосфотазу, то пептид вернется в предыдущую конформацию. Похоже на версию Антона, но наоборот. Домен это “маячок”, а пептид меняет форму. МБК тоже кажется поддерживает эту версию, по ней именно к пептиду добавляется фосфор.