Нахождение копий протеинов в гель SDS


можете помочь

1 симпатия

Так как концентрация белка 200mg/ml, то в одной клетке млекопитающего будет:

\ m= 200 \frac{mg}{ml} \times 1000 um^{3}=2*10^{-4} ug.

а в одной клетке бактерии:

\ m= 200 \frac{mg}{ml} \times 1 um^{3}=2*10^{-7} ug.

Тогда, найдем количество копий белка, которое содержится в этих массах белков. Для этого сначала найдем количество молей:

\ n (mammalian)=\frac{2*10^{-4} ug}{12*10^{10}ug/mol}=1.6*10^{-15} moles
\ n (bacterial)=\frac{2*10^{-7} ug}{12*10^{10}ug/mol}=1.6*10^{-18} moles

Теперь посчитаем количество копий белка в одной клетке:

\N =N (Avogradro)\times n(moles)
\N (mammalian)=6.02*10^{23}\times 1.6*10^{-15} = 9.6*10^{8} copies
\N (bacterial)=6.02*10^{23}\times 1.6*10^{-18} = 9.6*10^{5} copies

Теперь посчитаем количество молекул, для того чтобы белок был виден на геле:
2*10^{-4}ug - 9.6*10^{8}\ copies
10ng - x\ copies

\N=\frac{10 ng\times 9.6*10^{8}}{2*10^{-1}ng}=4.8*10^{10} copies

Мне кажется я что-то пропустила, но суть должна быть понятна

4 симпатии

А мне кажется \pu{200 mg mL-1} это концентрация всех белков в клетках.

В любом случае, как мне кажется, расчет стоит начинать с \pu{10ng}. Из этой массы мы уже можем узнать количество копий, вопрос только в том, во сколько раз копий должно быть больше в клетке.

Я думаю, что из концентрации белка и объема клетки можно узнать общую массу белков. Возможно подразумевается, что клеточный экстракт это и есть все белки, поэтому найдя отношение полученной массы к \pu{100 \mu g}, мы получим коэффициент на который нужно умножить число копий.

Например, для млекопитающих:

N = \frac{\pu{10*10^{-9} g * 6.02214086 * 10^{23} mol-1}}{\pu{120 g mol-1}} \cdot \frac{\pu{200 mg mL-1 * 1000 \mu m3 \cdot 10^{-18} \frac{m^3}{\mu m^3}} \cdot 10^6 \frac{mL}{m^3}}{\pu{100*10^{-6} g }\cdot 10^3 \frac{mg}{g} }
N \approx 1.004 \cdot 10^8
2 симпатии

Скорее всего так и есть иначе непонятно почему дана масса клеточного экстракта. Тогда правильный ответ 10^8 копий белка в клетках млекопитающих и 10^5 копий белка в бактериальных клетках.

1 симпатия
© 2021 Общественный Фонд «Beyond Curriculum» (CC BY-NC-SA 4.0 International)