Вот вам и приблизительное значение угла. Чтобы провести более точный расчет, надо взять эту геометрию в качестве стартовой точки, посчитать энергию через уравнение Шредингера, потом потихоньку начинать менять позиции атомов в направлении уменьшения общей энергии пока не дойдем до минимума. Что, за вас, делает софт.