МБК, 3 чаптер, протеины. Можете объяснить изменение заряда, pKa аминокислот в гидрофобной, неполярной среде?

Заряд группы будет зависеть от кислотности среды.
RCOOH - донор протона в среде более щелочной, чем pKa; RCOO(-) акцептор в более кислой
RNH2 - акцептор протона в более кислой среде, чем его pKa; RNH3(+)донор в более щелочной
Видимо, задача предполагает также, что группы с противоположными свойствами будут забирать у друг друга протон, но, опять же, это будет зависеть от величины pKa.

1 симпатия

Не обязательно. Значение pKa зависит от среды, в которой находится молекула. Если обозначим pKa в нейтральной среде как pKa_н, то в кислой среде это будет pKa_к. Для одного и того же соединения, pKa_к > pKa_н.

Почему? Важно понимать, что значение pKa обуславливается термодинамическими факторами. Например, (де)стабилизацией (де)протонированных форм. Например, если что-то стабилизирует RCOO^-, то pKa будет падать. Что может стабилизировать RCOO^-? Наличие положительного заряда рядом (или частично положительного). А что может его дестабилизировать? Гидрофобное окружение.

Аналогичные рассуждения применимы и к щелочной среде.

3 симпатии
© 2021 Общественный Фонд «Beyond Curriculum» (CC BY-NC-SA 4.0 International)